進化論基本的概念，很多人不知道，其實早在早期教會，就已有好幾個聖人有談及。其中最全面之一是聖奧思定的 “seminal theory”—「種子理論」。
據奧思定說，天主創造萬物，並不需要一切都是固定而不變的，而是有如種子：天主可在創造之中，預先包含了隱藏的潛力，待有需要時，隨着時間和環境逐漸發展。現在見不到的，不代表天主不早已種植在可見的事物中；現在新出來的，也其實早已蘊藏在最初的創造之中。天主早已安排好了。
所以現代進化論的問題，並不在於生物可否進化，而是達爾文將可以進化等同於創造，認為因此一切都是自然而來的，並沒有神，也並不需要一個創造者。這個斷案是不科學的，因為他和以後的進化論家，至今仍不能證明這一點。
天主教接受「小進化」，如一種鳥能因環境需要而演變出另一種。但天主教對「大進化」，如魚單靠「適者生存」而能變出鳥，卻抱有極大懷疑，因為科學上沒有足夠這樣大進化的證據。
很簡單的一個問題：魚與鳥之間的基因雖然接近，但要生出一對有用的翼來，在基因上的變化可是萬萬中無一。即是說，如果單憑自然而混亂，無意識的力量，如輻射，是絕對沒可能有系統地由魚進化出鳥來的。更甚的事，若果有足夠的輻射可以產生這大型的進化，應該有很少數成功，而非常大量的失敗品。但我們卻從來沒有找到這些非常大量的魚不成魚、鳥不成鳥的化石。它們去了哪裏？所以如果魚要進化成鳥，唯一科學的解釋，就是有一個有意識的力量指引這進化，這我們相信就是天主了。再直接些來說，要相信無意識的自然力量能恰巧製造這種大進化，其之渺茫，比之要信有創造者可更高。
從猿猴到人也是一樣。而再想，由單細胞生物要進化成人，要是一次大進化之渺茫的幾多次方？任何有責任的科學者都必要說，絕對不可能！或，絕對是要背後有一個有意識的，極高智慧和組織能力的力量。那不是天主是誰？
留意一點：達爾文並不是一個負責任的科學家。在他成名作 “Origin of Species” 中， 即是他發表人是從猩猩來的一書中，他寫道：人的智慧我們不知道是從而來，所以暫時將之擱置，那我們就可看到，人和猩猩很相似。因此，人就是從猩猩進化來的，而智慧一定是從中進化出來的。這種推論是叫做「先入為主」，是不合邏輯，也絕對不科學！人和猩猩最大的分別，不，人和所有其他生物最大的分別，就正正是人的智慧與理解，正正是要解釋的問題。怎可將之擱置，而先成立進化論，然後草草說這個不能解釋的問題，自然就是進化出來的？這簡直就是無賴！這樣跟說暫時不看我與你誰欠誰錢，那我和你最大分別就是我賺錢多過你，那一定是你欠我錢了，一般無賴。
總括來說：天主教接受小進化論，因為天主藉科學證據，啟示了同類進化的真實。但大進化，我們相信，若是真的，天主的手必在其中指引，因為科學並沒有任何確實證據，反而指向背後必須有一個有意識和智慧的力量才可成就。